Текущие:
- «Локализация белков RecN и RecA в клетке в процессе SOS-ответа»
Руководитель: Наталия Морозова
Грант РНФ
Срок выполнения: 2024-2026 - «Конформационные состояния рекомбиназы RAD51»
Руководитель: Александр Андреев
Грант РНФ
Срок выполнения: 2024-2026 - «Выяснение молекулярных механизмов действия бактериальных SMC-подобных комплексов»
Руководитель: Алексей Ведяйкин
Грант РНФ
Срок выполнения: 2024-2027 - «Поиск мембранных везикул вирусного происхождения у гигантского бактериофага, не образующего фаговое ядро»
Руководитель: Дарья Антонова
Грант РНФ
Срок выполнения: 2025-2026 - «Изучение молекулярно-генетических механизмов возникновения и анализ последствий неврологических осложнений острых респираторных вирусных инфекций»
Руководитель: Андрей Владимирович Васин
Государственное задание
Срок выполнения: 2024-2026
Завершённые:
- «Оказание услуг по проведению лабораторных исследований для разработки панели молекулярно-генетических биомаркеров в периферической крови для диагностики и мониторинга терапии мочекаменной болезни»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Договор оказания услуг с СПб ГБУЗ Клиническая больница Святителя Луки
Срок выполнения: 2024 - «Исследование состава, структуры и свойств нуклеотид связывающих белков»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Договор НИР с ООО «НПФ Синтол»
Срок выполнения: 2024 - «Разработка универсальной диагностической платформы на основе технологий CRISPR-Cas для выявления инфекционных заболеваний»
Руководитель: Наталия Морозова
Приоритет 2030
Срок выполнения: 2022-2024
- «Поиск малых фаговых белков, обладающих бактерицидной активностью»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Договор НИР с МГУ, биологический факультет в рамках гранта РНФ № 24-44-02003 от 20.03.2024 «Функциональные и структурные подходы к улучшению селекции и дизайна бактериофагов для применения в антибактериальной терапии»
Срок выполнения: 2024
- «Исследование механизмов действия белка RecN — когезин-подобного компонента бактериального SOS-ответа»
Руководитель: Наталия Морозова
Грант РНФ
Срок выполнения: 2022-2024 - «Разработка новых антибактериальных соединений на основе фаговых белков»
Руководитель: Мария Якунина
Приоритет 2030
Срок выполнения: 2022-2023
- «Определение концентрации NAD и его метаболитов в биологических образцах методами ЯМР спектрометрии»
Договор с ИНЦ РАН в рамках гранта РНФ № 21-14-00319 «Роль NAD в регуляции плюрипотентности и дифференцировки эмбриональных стволовых клеток мыши»
Срок выполнения: 2021-2023 - «Роль мобильных генетических элементов в эволюции CRISPR-Cas систем»
Руководитель: Александр Якимов
Грант РНФ
Срок выполнения: 2021-2023 - «Поиск новых механизмов регуляции бактериального деления в состоянии SOS-ответа»
Руководитель: Алексей Ведяйкин
Грант РНФ
Срок выполнения: 2022-2023 - «Флуоресцентная визуализация внутриклеточных структур с молекулярным разрешением»
Руководитель: Алексей Ведяйкин
Грант Президента РФ
Срок выполнения: 2022-2023 - «Разработка новых инструментов геномного редактирования в клетках эукариот»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Договор с ИБГ РАН
Срок выполнения: 2020-2022 - «Неканонические функции системы CRISPR-Cas бактерии Clostridioides difficile»
Руководитель: Анна Майкова
Грант Президента РФ
Срок выполнения: 2021-2022 - «Факторы регуляции системы CRISPR-Cas патогенной бактерии Clostridioides difficile»
Руководитель: Анна Майкова
Грант РНФ
Срок выполнения: 2020-2022 - «Изучение инфекции клеток патогенных бактерий гигантскими бактериофагом phiKZ»
Руководитель: Мария Якунина
Грант РНФ
Срок выполнения: 2019-2022 - «Молекулярные механизмы регуляции белка RecA, активатора бактериального SOS-ответа»
Руководитель: Егор Побегалов
Грант РНФ
Срок выполнения: 2019-2022 - «Регуляция транскрипции молекулярными барьерами различной природы»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
Срок выполнения: 2021 - «Определение механизмов деления «минимальных» бактерий, лишенных ключевого белка деления FtsZ»
Руководитель: Алексей Ведяйкин
Грант РФФИ
Срок выполнения: 2020-2021 - «Разработка и валидация биоаналитических методик определения лекарственных препаратов в физиологических жидкостях и тканях»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Договор с «ЦКП Аналитическая спектрометрия»
Срок выполнения: 2017-2020 - «Идентификация белков микоплазм, полученных из клеточных экстрактов методом со-осаждения, с помощью масс-спектрометрического анализа»
Договор с ИНЦ РАН, в рамках гранта РНФ № 17-74-20065 «Стрессовые белки и белки бактериального цитоскелета микоплазм — возбудителей заболеваний сельскохозяйственных растений и животных как факторы вирулентности и персистенции бактерий и потенциальные мишени для контроля микоплазменных инфекций»
Срок выполнения: 2019 - «Транспортируемые аденоассоциированными вирусами нуклеазы для нового поколения препаратов генной терапии наследственных заболеваний»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Договор со Сколтехом, в рамках соглашения № 14.606.21.0006 ФЦП «Исследования и разработки»
Срок выполнения: 2017-2019 - «Научно-технические сотрудники на постоянной основе»
Руководители: Татьяна Артамонова, Егор Побегалов, Алексей Ведяйкин
Государственное задание
Срок выполнения: 2017-2019 - «Ведущие исследователи на постоянной основе»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Государственное задание
Срок выполнения: 2017-2019 - «Структура и свойства уникальной невирионной РНК-полимеразы бактериофага phiKZ»
Руководитель: Мария Якунина
Грант РНФ
Срок выполнения: 2017-2019 - «Механизмы регуляции митохондриального пула NAD в клетках человека»
Руководитель: Вероника Куликова
Грант РНФ
Срок выполнения: 2018-2020 - «Исследования внутримолекулярных переходов»
Руководитель: Алексей Мельников
Государственное задание
Срок выполнения: 2017 — 2019 - «Идентификация белков микоплазм и Escherichia coli, полученных из клеточных экстрактов методами ко-иммунопреципитации и со-осаждения, с помощью масс-спектрометрического анализа»
Договор с ИНЦ РАН, в рамках гранта РНФ № 17-74-20065 «Стрессовые белки и белки бактериального цитоскелета микоплазм — возбудителей заболеваний сельскохозяйственных растений и животных как факторы вирулентности и персистенции бактерий и потенциальные мишени для контроля микоплазменных инфекций»
Срок выполнения: 2018 - «Количественный анализ NAD и его основных метаболитов в экстрактах культивируемых клеток человека, а также в органах и тканях мышей методом ЯМР спектроскопии «
Руководитель: Сергей Вадимович Мурашов
Договор с ИНЦ РАН, в рамках гранта РНФ «Новые производные витамина B3: молекулярные механизмы действия и потенциальные терапевтические эффекты»
Срок выполнения: 2018 - «Исследование физико-химических свойств пептидов методом ядерно магнитного резонанса с использованием ЯМР спектрометра Varian DirectDrive NMR System 700 Mhz»
Договор с НИЦ «Курчатовский институт»-ПИЯФ
Срок выполнения: 2018 - «Экспериментальное обоснование возможности разработки технологии подавления реакции отторжения донорских клеток посредством манипуляций с генами главного комплекса гистосовместимости «
Руководитель: Сергей Вадимович Мурашов
Государственное задание
Срок выполнения: 2018 - «Изучение субстратной специфичности ферментов синтеза лассо-пептидов и их структурная характеристика»
Руководитель: Михаил Метелев / Татьяна Зюбко
Грант РФФИ
Срок выполнения: 2016 — 2018 - «Количественный анализ NAD и его основных метаболитов в экстрактах культивируемых клеток человека, а также в органах и тканях мышей методом ЯМР спектроскопии»
Руководитель: Сергей Вадимович Мурашов
Договор с ИНЦ РАН, в рамках гранта РНФ «Новые производные витамина B3: молекулярные механизмы действия и потенциальные терапевтические эффекты»
Срок выполнения: 2017 - «Оптимизация метода ЯМР спектроскопии для количественного анализа NAD метаболитов и АТФ в экстрактах культивируемых клеток человека, а также в органах и тканях мышей»
Руководитель: Сергей Вадимович Мурашов
Договор с ИНЦ РАН, в рамках гранта РНФ «Новые производные витамина B3: молекулярные механизмы действия и потенциальные терапевтические эффекты»
Срок выполнения: 2016 - «Разработка и исследование антибактериальных пептидовнового поколения с существенно лучшими свойствами на основе генетически модифицированных микроцинов»
Руководитель: Константин Северинов
Договор со Сколковским институтом науки и технологий
Срок выполнения: 2014-2015 - «Обеспечение проведения научных исследований»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Государственное задание
Срок выполнения: 2014-2016 - «Обеспечение проведения научных исследований»
Руководители: Татьяна Артамонова, Егор Побегалов, Александр Григорьев
Государственное задание
Срок выполнения: 2014-2016 - «Неканонические мультисубъединичные РНК полимеразы гигантского бактериофага phiKZ
Руководитель: Мария Якунина
Грант РФФИ
Срок выполнения: 2016 — 2017 - «Механизмы действия экзогенного NAD и его ключевых метаболитов в качестве эффективных предшественников внутриклеточного NAD»
Руководитель: Александр Якимов
Грант РФФИ
Срок выполнения: 2016 — 2017 - «Изучение механизмов образования и взаимодействия вне- и внутриклеточных пулов рибозидов никотинамида и никотиновой кислоты — потенциальных терапевтических агентов для лечения нейродегенеративных заболеваний и патологий, связанных с нарушением метаболизма»
Руководитель: Вероника Куликова
Стипендия Президента РФ молодым ученым и аспирантам
Срок выполнения: 2015 — 2017 - «Исследование молекулярных механизмов работы белка FtsZ, являющегося перспективной мишенью при создании новых высокоэффективных антибактериальных препаратов»
Руководитель: Алексей Ведяйкин
Стипендия Президента РФ молодым ученым и аспирантам
Срок выполнения: 2015 — 2017 - «Молекулярная, экологическая и прикладная микробиология»
Постановление Правительства Российской Федерации № 220
«О мерах по привлечению ведущих ученых в российские образовательные учреждения высшего профессионального образования» (мегагрант)
Срок выполнения: 2013 — 2017 - «Исследование механизмов и динамики нуклеотид-связывающих белков: от бактерий до человека»
Руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
Грант РНФ
Срок выполнения: 2014 — 2016 - «Комплексное исследование путей биосинтеза NAD в клетках человека»
Руководитель: Андрей Никифоров
Грант РФФИ
Срок выполнения: 2014 — 2016 - «Идентификация и функциональная характеристика новых лассо-пептидов, обладающих антибактериальной активностью»
Грант Фонда «Династия»
Срок выполнения: 2015 - «Микробиология, Протеомика, Фармакология»
Проект (510-02) 0-20
Срок выполнения: 2014 — 2015 - «Изучение потенциальной роли цитозольных 5»-нуклеотидаз человека в метаболизме NAD»
Грант РФФИ
Срок выполнения: 2014 — 2015 - «Исследование механизмов работы эукариотических белков TIP49»
Грант РФФИ
Срок выполнения: 2014 — 2015 - «Визуализации белков в одномолекулярных биофизических экспериментах с помощью новых триплетных люминофоров на основе полиядерных комплексов переходных металлов»
Грант РФФИ
Срок выполнения: 2013 — 2015 - «Одномолекулярные исследования ДНК-связывающих свойств перспективных белковых мишеней для терапии гепатокарциномы»
Стипендия Президента РФ молодым ученым и аспирантам
Срок выполнения: 2013 — 2015 - «Single-molecule studies of DNA-binding ATPases Pontin and Reptin using optical tweezers»
Грант от компании ОПТЭК, поддержка молодых ученых ведущих высших учебных заведений и научных исследовательских центров
Срок выполнения: 2013 - «Изучение механизмов образования и взаимодействия внутри- и внеклеточных пулов ключевых NAD-метаболитов»
Грант РФФИ
Срок выполнения: 28.11.2012–31.12.2013 - «Исследования на одномолекулярном уровне свойств ДНК-субстрата при связывании с белками TIP49»
Грант РФФИ
Срок выполнения: 08.11.2012–31.12.2013 - «Исследование структур, формируемых белком FtsZ, в клетках Mycoplasma hominis методом локализационной микроскопии»
Грант РФФИ
Срок выполнения: 08.11.2012–31.12.2013 - «Роль доменов и междоменных линкеров в регуляции филаментов актина белками семейства виллина»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009–2013 годы мероприятия 1.5 по лоту «Поддержка научных исследований, проводимых коллективами под руководством приглашённых исследователей по научному направлению «Науки о жизни (Живые системы)» в следующих областях: — Биокаталитические, биосинтетические и биосенсорные технологии, — Геномные, протеомные и постгеномные технологии, — Клеточные технологии, — Биоинженерия»
Срок выполнения: 17.09.2012–15.11.2013 - «Транскрипционный контроль в ходе инфекции Pseudomonas aeruginosa гигантскими фагами типа φKZ»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009–2013 годы мероприятия 1.5 по лоту «Поддержка научных исследований, проводимых коллективами под руководством приглашённых исследователей по научному направлению «Биология, медицина» в следующих областях: — Общая биология и генетика, — Физико-химическая молекулярная и клеточная биология»
Срок выполнения: 10.09.2012–15.11.2013 - «Проведение центром коллективного пользования научным оборудованием «Аналитический центр нано- и биотехнологий ГОУ СПбГПУ» научно-исследовательских работ в области живых систем путем развития методов диагностики состава, структуры и свойств биологически активных соединений»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007–2013 годы» мероприятия 5.2 по лоту «Обеспечение центрами коллективного пользования научным оборудованием комплексных исследований по приоритетным направлениям развития науки, технологий и техники в Российской Федерации»
Срок выполнения: 11.07.2012–21.07.2013 - «Исследования механических свойств клеточных мембран при помощи метода оптического захвата с использованием уникальной комплексной установки для исследования динамики нанобиомашин на одномолекулярном уровне (шифр УСУ «Лазерный пинцет»)»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007–2012 годы» мероприятия 1.8 по лоту «Проведение исследований с использованием уникальных стендов и установок по приоритетному направлению «Науки о жизни»»
Срок выполнения: 20.07.2012–25.07.2013 - «Исследование АТФ–зависимой динамики олигомеризации белков семейства TIP49 на индивидуальных молекулах ДНК»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007–2013 годы» мероприятия 1.9 по лоту «Работы по проведению проблемно-ориентированных поисковых исследований и созданию научно-технического задела по приоритетному направлению «Живые системы» с участием научных и исследовательских организаций стран Европейского Союза»
Срок выполнения: 18.08.2011–08.05.2013 - «Проведение исследований в области живых систем путем развития методов флюоресцентной микроскопии сверхвысокого разрешения с использованием уникальной комплексной установки для исследования динамики нанобиомашин на одномолекулярном уровне» (шифр УСУ «Лазерный пинцет»)
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007–2012 годы» мероприятия 1.8 по лоту «Проведение исследований с использованием уникальных стендов и установок в области живых систем»
Срок выполнения: 11.05.2011–16.11.2012 - «Протеомный анализ секретируемых нанобиоструктур (экзосом) человека, продуцируемых нормальными и онкотрансформированными клетками»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009–2013 годы мероприятия 1.1 по лоту «Проведение научных исследований коллективами научно-образовательных центров по проекту «Протеом человека»»
Срок выполнения: 29.11.10-15.11.2012 - «Проведение центром коллективного пользования научным оборудованием «Аналитический центр нано- и биотехнологий ГОУ СПбГПУ» научно-исследовательских работ в области живых систем путем развития методов диагностики состава, структуры и свойств биологически активных соединений»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007–2013 годы» мероприятия 5.2 по лоту «Проведение центром коллективного пользования научным оборудованием научно-исследовательских работ в рамках основных направлений реализации федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007–2013 годы»
Срок выполнения: 29.07.2011–06.08.2012 - «Исследование механизмов формирования углеродсодержащих микро– и наноструктур в процессе сокарбонизации растительных полимеров, жидких углеводородов и аренов каменноугольного происхождения»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009–2013 годы мероприятия 1.5 по лоту «Проведение научных исследований коллективами под руководством приглашенных исследователей в области химии и новых материалов»
Срок выполнения: 12.03.2010–15.11.2010 - «Исследование динамики конформационных изменений ДНК вызванных факторами структурной перестройки хроматина методами оптической ловушки («лазерный пинцет») и молекулярного моделирования»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009–2013 годы мероприятия 1.5 по лоту «Проведение научных исследований коллективами под руководством приглашенных исследователей по следующим областям: — биология, сельскохозяйственные науки и технологии живых систем; — медицина; — наука о Земле, экология, рациональное природопользование»
Срок выполнения: 10.06.2010–15.11.2011 - »«Проведение исследований в области живых систем с использованием лазерно-оптической системы для анализа функционирования трехмерных наносистем входящей в состав уникальной комплексной установки для исследования динамики нанобиомашин» (шифр УСУ «Лазерный пинцет»)»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России» на 2007–2012 годы по лоту «Проведение исследований в области живых систем с использованием уникальных установок»
Срок выполнения: 08.08.2009–30.11.2010 - «Исследование взаимного влияния переноса заряда и кинетической энергии нейтральных молекул фуллеренов на формирование поверхностных наноструктур»
Проект РФФИ
Срок выполнения: 2008–2010 - «Масс-спектрометрическая идентификация регуляторных клеточных белков фосфатазы PP1, участвующих в репликации вируса иммунодефицита человека (ВИЧ)»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009–2013 годы мероприятия 1.5 по лоту «Проведение научных исследований коллективами под руководством приглашенных исследователей в области медицины»
Срок выполнения: июль 2009–август 2010 - «Структурная протеомика окислительно-восстановительных белков вовлеченных в регуляцию последствий окислительного стресса»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009–2013 годы мероприятия 1.5 по лоту «Проведение научных исследований коллективами под руководством приглашенных исследователей в области биологии, сельскохозяйственных наук и технологии живых систем»
Срок выполнения: июль 2009–август 2010 - «Разработка модели и исследование нанокомплексов благородных газов, предназначенных для использования в лазерных системах с участием научных организаций Швеции»
Научно-исследовательская работа в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России» на 2007–2012 годы
Срок выполнения: октябрь 2009–сентябрь 2010