Лаборатория молекулярной микробиологии была создана в 2013 году в целях реализации постановления Правительства Российской Федерации №220 «О мерах по привлечению ведущих ученых в российские образовательные учреждения высшего профессионального образования» (мегагранты) и в рамках выполнения работ по договору № 14.В25.31.004 от 28.06.2013 г. под руководством Константина Северинова.